双股分离在DNA合成之前
双股螺旋构造会自动地被DNA解旋酶 (helicase) 解开。
大肠杆菌最主要的解旋酶,是形成六合体 (hexamer) 的蛋白质DnaB。
解旋酶不会损毁DNA,只是干扰维持碱基聚合在一起的氢键。此过程需要能量的供应,而能量由解旋酶降解ATP所提供。
亲代DNA分离的两股为互补,所以可互相配对。为了制造出新的股,原来的两股必须分离,当作模板使用。
这工作由单股结合蛋白质 (single strand binding protein; SSB protein) 来完成。此蛋白质可以结合在未配对的单股上,
避免两段原来股重新黏合。